Pense duas vezes (melhor, pense várias vezes).
Leia o artigo do professor Maziero e entenda alguns dos motivos pelos quais não usar.
Depois, vá no projeto abnTex e veja a opinião deles a respeito do uso das normas em trabalhos acadêmicos.
Como professor da área de Ciência da Computação, acredito que devemos utilizar os padrões pedidos pela SBC (Sociedade Brasileira de Computação) para publicações.
Ao menos, sempre que solicito trabalhos acadêmicos aos meus alunos peço que o padrão a ser utilizado seja o de artigo (Latex, Word, OpenOffice) para congressos.